Den 1 september 2011 gick projektet in i själva genomförandefasen varvid Kultudralen AB tog över projektet och totalentreprenör har varit byggnadsbolaget PEAB. Under några intensiva månader arbetades det ivrigt i ruinen, i ur och skur, i köld och blåst, med att gjuta gradänger, bygga valvtak, sätta glas i fönstren, bygga scen, lägga stengolv och uppförandet av en servicebyggnad med artistloger, toaletter och biljettkassa. Allt för att snygga upp ruinen och göra den bättre anpassad för att ta emot både besökare, artister och publik, brudpar, konferenser och middagsgäster.

Ruinen kunde så återöppna i samband med nationaldagsfirandet 6 juni 2012 i närvaro av kungaparet. Själva öppningsceremonin förrättades av kulturminister Lena Adelsohn Liljeroth.

Genom arkitektoniskt nytänkande har S:t Nicolais kvaliteter från 1200-talet förenats med 2000-talets teknik för ljus, ljud och komfort. S:t Nicolai Kultudral kan nu användas för större och mindre musikevenemang, teater, dans, fester och middagar, föreläsningar och konferenser.